争议一：内容删减体现创新精神新版教科书，初中的中国史和世界史被从三年压缩到了两年，而高中仅有的一年历史课如今只集中于文化、思想、文明。王朝更替、国家兴亡，革命与战争，殖民与反殖民等传统的历史编纂内容全都没有，通常的编年的历史时代也不见，代之以“大河文明”、“海洋文明”、“草原文明”等泛泛而谈的内容。

　　反对者认为，上完这套教材，你基本上不知道各个西方国家的盛衰，你也不会知道中国近代的屈辱，你也看不到十月革命、法国革命，也不会知道拿破仑、希特勒、斯大林、毛泽东的具体事迹。

　　持赞同意见的香港大学副教授白杰瑞认为，中国内地的教育当局寻求各种途径使学校课程跟上时代。他说：“过多强调殖民时代民族苦难的历史，是否能造就今天的上海所需要的高级人才？”

　　有网友认为，中国多数农民起义起因相似，书写历史不需要毫无进展的重复再重复。还有网友则从上海历史教科书的修改中，看到了中国教育改革的决心，他认为我们必须从过去历史的泥淖中挣脱出来，除去历史意识形态渗透的毒素。

　　争议二：文明史取代编年史

　　据2004年11月上海市教委印发的《〈上海市中学历史课程标准（试行稿）〉说明》：初、高中的课程内容都是以历史唯物主义为指导，以文明史为线索、框架而编制的。初中阶段学习中国历史和世界历史。高中则以“人”、“生产力”、“交往”等影响文明进程的要素为内核架构主题，涵盖政治、经济、文化、宗教、社会生活等人类文明发展过程与成果的各个重要层面，以点带面，凸现文明特征。反对者网友“陶短房”认为，这就是在消灭历史。一套没有历史年代、历史事件、历史人物和历史事迹的“历史教科书”，到底想给青少年传播怎样的历史观？赞同者认为，对于一个初高中生来说，不知道汉武帝跟不知道路德维希二世不重要。只要通过六年的历史学习，他能了解到自己所归属的中国文明的魅力，能做个地道的中国人，走出国门不至于被淹没同化在复杂的种族人群中是教育的成功。

　　争议三：全球史观完胜民族史观

　　反对者说，这种所谓宏观的全球史观，和其他国家形成鲜明的对比：目前，世界各国不论历史悠久还是短暂，政治制度和国体如何，对于中学历史教科书该如何编写，该承载怎样的教育功能，看法却惊人的一致，几乎都把对学生的爱国主义教育和民族精神培养放在最重要的位置。

　　赞同者则认为历史本是互相关联着的。全球史观更倾向于一种人类学的宏观角度，抹去后代人为设定的国别与编年，将历史以最原始最统一最完整的形态展现出来。历史教育的重点并不是在于记住多少事件发生的时间，而是培养学生思考历史的方法和能力。

　　争议四：时代元素代替经典内容

　　新版教科书增加了文化和科技等新课题，经济成长、发明创造、对外贸易、政局安定、全球化和社会和谐出现在教材里；摩根、盖茨、纽约股票交易市场、美国太空船、日本子弹列车等具有强烈时代特征的事物也都出现在新版教材的显著位置。

　　一名高中教师在网上讽刺说：“你想要学生记住古代服饰的设计，还是秦国于公元前221年统一中国？”风云变幻的历史事件和人物都被一些解说旧风俗和服饰的篇幅取代，历史课已经失去了它应有的重点。这到底是历史书还是百科全书？

　　赞同者认为，在不同的社会年代，人类对事物认知也应该允许有其侧重点。今天的孩子需要去根据他们生存的世界来了解他们需要的知识。全球化经济，地球村共存、和谐社会、和谐人生应该成为当今社会的主题，因此经济改革需要教育的改革来适应。以新世纪的名义，教育要面向未来的需要，教科书内容应该与时俱进。