1979年1月,薄一波出任国务院副总理。
邓小平首倡创办经济特区,是一个重大战略决策,是改革开放的一个重要方面。当时,党内意见并不统一,不少人不理解,甚至怀疑。
薄一波对办经济特区这一新生事物是满腔热忱,从一开始就给予大力支持,他是最早在特区考察的领导人之一。
1981年11月就到深圳、珠海、汕头、厦门特区考察,以后又去了几次。薄一波认为办特区的决策是对的,路子也是好的,是有发展前途的,应该予以充分肯定。同时,针对当时的情况,也指出了值得注意和改革的问题。
1982年,为了适应改革的需要,中央决定成立国家经济体制改革委员会,薄一波又被委以重任,负责体改委的工作,为党中央和国务院改革大计当好参谋,为改革开放的总设计师邓小平献计献策。
中共十二大决定成立中央顾问委员会。这是邓小平着力改革党和国家领导体制的一个重大举措。薄一波主持中顾委日常工作10年,其中前5年是作为主任邓小平的助手,后5年是作为主任陈云的助手,为实现党的中央领导集体的新老交替,以及受命处理党内若干重大问题等方面,发挥了重要的作用。
1981年11月18日,本报刊发薄一波视察厦门的新闻。
此外,薄一波还曾于1987年为集美的“李林烈士纪念馆”题词:“李林烈士,女中豪杰;为国捐躯,永垂史册”。