由中国科学院、世界自然基金会和国家开发银行联合组织编撰的《长江保护与发展报告2009》认为，在梯级开发的淹没区，由于环境条件发生变化，由流水变成缓流甚至静水，原来许多喜急流生活的鱼类，将因不适应环境而消失。此外，多座水库的影响会产生叠加效应，使得水温的变化幅度变大，对鱼类的影响也更严重。

　　对此，马军说:“我们已经多次论证，有关部门采取的生态补救措施效果有限。我们希望在进行水资源开发的时候……更多详细水博：细说国有电力企业补票永远能成功的利弊我国金沙江全流域规划的12个梯级电站，装机总容量可达7500多万千瓦，年发电量近3500亿千瓦时。加上金沙江开发后对下游长江三峡等水电站的补偿效益，整个金沙江水电开发后相当于每年能给国家提供近二亿吨原煤，相应的环境效益每年可减少排放二氧化碳4亿多吨、二氧化硫三百余万吨，少排放粉尘约四千余万吨，每年减少酸雨损失、人体健康损失和全球气候变化的损失约数百亿元。当我们的反坝组织和人士借着叫停金沙江违规整顿的机会，大肆炒作大坝可能会对某种濒临灭绝的鱼类如何如何危险的同时，不要忘记，由于人类温室气体过量排放的威胁，世界上将有一半的物种会濒临灭绝。金沙江水电正是我们解决这一人类难题的答案之一。