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产前诊断CNV结果的分类

按照国际标准,产前诊断的CNV( 拷贝数变异) 结果可分为以下5 类:

【致病性CNV

是指无论其是否存在外显率不同或表现度差异,均应判定为致病性。包括以下情况:覆盖已知明确的微缺失/ 微重复综合征的致病区域;缺失片段包含明确单倍剂量不足(HI) 基因;重复片段包含明确三倍剂量敏感(TS) 基因;按照ClinGen 致病性CNV 综合评分网站(http://cnvcalc.clinicalgenome.org/cnvcalc/) 得分≥0.99

【可能致病性CNV

存在证据表明很可能致病,但目前尚不足以得出肯定的结论。包括以下情况:缺失片段未包含整个HI 基因、但涉及HI 基因的5 ′端( 含编码区) ;缺失片段未包含整个HI 基因但涉及HI 基因的多个外显子( 3 ′端) ;缺失片段包含可疑HI 基因或重复片段包含可疑的TS 基因;按照ClinGen 致病性CNV 综合评分网站得分0.90 0.98

VUS

指临床意义不明的CNV(VUS) ,目前尚无法进行分类,但通过研究的累积,未来可能被定义为致病性或良性。包括以下情况:不包含编码蛋白或有重要功能的基因,但超过了实验室定义的出具报告的片段阈值;包含少量基因,但基因剂量敏感性未知;虽在文献中有报道,但结论不一致,确切临床意义尚无结论;位于基因内部,但尚不明确是否影响编码框;按照ClinGen 致病性CNV 综合评分网站得分- 0.89 0.89

【可能良性CNV

指已存在证据表明与孟德尔遗传病无关,但目前尚不足以得出肯定的结论。包括以下情况:在病例人群和对照人群中出现频率无统计学差异;含有基因的CNV 在正常人群中多次报道,但频率<1% ;超过了实验室定义的出报告的片段大小阈值,但该区域内无基因;按照ClinGen 致病性CNV 综合评分网站得分介于-0.98 -0.90

【良性CNV

在多篇同行评议文献或数据库中报道为良性变异,或CNV 本身就是常见的多态性;在DGV 数据库或实验室内部数据库中发生频率>1% ;或在正常人群中有报道,虽频率<1% ,但该CNV 不涉及基因;或按照ClinGen 致病性CNV 综合评分网站得分≤-0.99

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