Crispr cas12a是一种可编程的DNA内切酶,它可以根据crRNA的设计实现对不同DNA的精确识别与切割。在靶DNA的指导下,Cas12a核酸酶域会被激活并进行DNA内切,实现了对靶DNA的高效识别和放大。这一原理使其可以作为DNA诊断工具,crRNA的设计决定了其特异性。但Cas12a附带切割效应也使非特异性信号放大成为可能,这需要在应用中加以考量。Cas12a的深入研究将有助于理解DNA内切机制,也为工程化DNA工具的开发提供基础。
规格参数:
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Cas12a主要特点
1.来源:
cas12a来源于微生物的CRISPR-Cas免疫系统,是其中一种type V CRISPR系统中的效应分子。
2. 结构:
cas12a是一个多功能蛋白,包含RNA结合域、核酸酶域和DNA结合域。其中核酸酶域具有DNA内切酶活性,可以在激活后非特异性地切割DNA。
3. 指导RNA:
cas12a需要与crRNA结合才具有活性,crRNA与其靶DNA互补的序列决定了cas12a的识别靶向性。多个crRNA可以共同作用于一个cas12a。
4. 活性调控:
在结合crRNA前,cas12a处于不活性状态。只有当crRNA完全与靶DNA退火时,其核酸酶域才会被激活,对DNA进行内切。这实现了对其活性的精确控制。
5. DNA内切:
激活后的cas12a会首先在靶DNA的crRNA结合位点产生双链断裂,切出一段DNA片段;然后会对周围DNA进行非特异性切割,产生较短DNA片段。这实现了对靶DNA的内切和信号放大。
6. 自身调控:
cas12a在激活后也会逐渐失去活性,这在一定程度上限制了其非特异性DNA内切的范围。但在DNA浓度高的条件下,仍可能产生较大范围的非特异性切割。
7. 应用:
cas12a可用于DNA的高灵敏度检测、基因编辑、转基因等应用。crRNA设计决定了其靶向性,继而影响其应用效果。但非特异性切割也需要在应用设计中加以控制。
Cas12a切割机理如下:
1. cas12a是一个多功能蛋白,含有双链DNA结合域和核酸酶域。其中核酸酶域具有DNA内切酶活性,可以非特异性切割DNA。
2. crRNA是处理过的RNA分子,含有与靶DNA互补的序列,可以特异性识别靶DNA。多个crRNA可以成簇,以提高靶向效率。
3. 在不存在靶DNA的情况下,cas12a的核酸酶活性是抑制的。crRNA与cas12a结合后,也不会激活其酶活性,维持不活性状态。
4. 当crRNA结合的cas12a与靶DNA发生碱基配对时,cas12a的核酸酶域会被激活,对周围的DNA分子进行非特异性切割。这被称为collateral cleavage效应。
5. 一旦被激活。cas12a会持续进行DNA内切割。直到周围没有可以被切割的DNA。这可以放大信号。增强检测灵敏度。
6. 激活后的cas12a也会被降解。这可以在一定程度上限制collateral cleavage效应。但在DNA丰富的条件下。仍可能产生较大范围的附带切割。
7. 利用这一原理。可以通过检测collateral cleavage产生的DNA片段来判断靶DNA是否存在。实现DNA的检测。这提供了高灵敏度和内切的DNA检测手段。
相关Crispr/cas酶:
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