作为上一届国务院组成部委中三位女部长之一的马馼，担任监察部长近六年，而她担任中纪委副书记已近10年。从中纪委到监察部，再到兼任国家预防腐败局局长，都是关系到党政队伍纪律根基的要害部门，马馼经历，也参与到了中国反腐体系不断建设完善的进程中。
2007年8月底，马馼“临危受命”被任命为监察部部长，4个月前，时任中纪委副书记、监察部部长李至伦因病逝世。在当时的28个国务院组成部委的一把手中，马馼是除了司法部部长吴爱英、国务院侨办主任李海峰之外的又一位女性部长。
担任部长一职五年多之后，她对媒体表示，“女性做反腐败工作，和男性是一样的，只要是非界限清晰，对腐败也不会手软。”
2007年，马馼上任监察部部长不到10天，就兼任了新设立的国家预防腐败局首任局长。几年来，在马馼的主导下，纪检监察部门试图从多种途径完善反腐制度，其中官员财产申报制度、“裸官”登记管理制度、公车改革、公开“三公经费”等受到较多关注。
马馼痛陈目前的反腐问题时表示，“现在出现了‘小官大贪’现象，从体量上构成老虎，但是级别很低。对于反腐败问题，大家都要使上劲儿，有苍蝇就打苍蝇，有老虎就打老虎。”
2009年，马馼在《中国监察》发表的一篇署名文章中明确提出，要充分发挥现代信息技术在预防腐败中的作用。今年两会期间，马馼告诉媒体记者，她也会上微博，关注信息，看大家提了什么建议，但自己很少写。她说，不写微博是因为“没有那么多时间，如果自己公开了微博用户名，却又没有时间及时回复网民，可能会造成不好的影响，因此选择‘潜水’。”
与此同时，马馼也呼吁对网络反腐一分为二地看：“百姓运用网络的方式举报，是自主的选择，我们应该以积极的态度来对待。但是网络反腐本身不是终极的，需要对线索进行核实才能确定，此外这也不是唯一的渠道。”
当被问及“情妇反腐”现象时，马馼坦言，不管是网络反腐还是其他方式的反腐，都应当从正面发挥作用，如果是利用女性引诱官员曝光一些反腐现象，这种方式不可取。“我一直不认为‘情妇反腐’是一个主要的反腐渠道。” 南都特派记者 吴瑶 发自北京
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