施捷 孙国根
本报讯 (记者 施捷 通讯员 孙国根) 复旦大学公共卫生学院青年教师熊成龙、张志杰等以先进的生物信息学手段,对本次H7N9禽流感病毒基因进行研究和分析,首次证实病毒两个最重要蛋白HA和NA起源于中国华东地区家禽或野鸟,而非先前中外学术界专家所认为的“分别来源于中国和韩国禽类”。
这一发现为准确推断流感病毒的起源与演化规律提供了必要的理论依据,同时对进一步研究流感病毒的传播与流行规律、早期预警流感传播,进而采取积极有效的预防控制策略等有重要指导意义。相关论文近日已在线发表于国际传染病领域著名期刊《临床感染病》(Clinical Infectious Diseases)。
今年2月,我国华东地区陆续出现系列流感样病例;3月31日,国家卫生计生委通报确认感染病原为新型H7N9亚型禽流感病毒。根据采集到的1株H7亚型HA(即H7N3病毒)来源于中国杭州鸭,而采集到的7株N9亚型NA(即H7N9病毒)则来源于韩国禽类,对于新型H7N9亚型禽流感病毒的起源,中外学术界专家普遍认为来自中韩禽类。
熊成龙、张志杰研究团队认同学术界对HA来源的报道,但对NA来源则有异议。基于“核苷酸是构成基因的最基本单位、氨基酸是构成蛋白的最基本单位,对核苷酸和氨基酸的同源进行分析,就能搞清楚病毒的起源和演化规律”的考虑,研究团队分析了全球共享流感数据库中(包括本次病原代表株H7N9病毒及2006年~2011年的7株韩国株NA亚型株)长度大于1000核苷酸的N9基因序列共321个NA序列,并由此推导出相应的蛋白质氨基酸序列。最终证实:H7N9禽流感病毒的最重要蛋白HA(N9基因)来源于中国江苏洪泽湖花脸鸭(即H11N9病毒株)。这一研究成果的最重要依据之一,是从基因核苷酸和蛋白质氨基酸序列相似性搜索结果看,H7N9病毒的最重要蛋白NA与H11N9病毒在核苷酸和氨基酸层次上序列的相似性,远高于与7株韩国株NA亚型株的相似性。同时,杭州是H7N3病毒的分离地,也是本次流感流行的主要疫区之一,洪泽湖是中国第4大淡水湖,是水禽的主要栖息地之一,也是H11N9病毒的分离地。他们认为,本次流感最初发生地、H7亚型HA贡献株分离地及H11N9病毒分离地均位于中国的华东地区,从地理位置上来看,病毒株发生重组的可能性也远高于韩国株。
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