日本因素是中国此次对俄外交中最大的挑战与考验。2002年始，日本就对俄罗斯的“远东线路”表现出很大兴趣。日本政府通过各种方式表达日本准备投资的愿望，以日俄合作为名对俄罗斯频频示好。

　　日本是石油进口大国，而俄罗斯是世界第二大石油生产国和能源出口大国，确保来自俄罗斯的稳定的石油供应，是日本“能源多样化”的战略要求。特别是，日本不希望中国独自控制东北亚地区的石油主动权和整个东南亚地区的燃料垄断权。在日本看来，一旦向远东蔓延的中国势力不能得到有效遏制，日本在东北亚的经济利益将受到直接威胁。争夺远东石油主动权已经成为维系日本在整个亚洲地区地位的重要举措。

　　日本的“韧劲”在这次石油管线问题上表现得极为突出，不到最后一刻，日本绝对不言放弃。

　　“二并一”方案显然是日本所不愿意接受的。为此，日本资源能源厅长官冈本严曾两度前往俄罗斯进行游说。前首相森喜朗、日本外务大臣川口顺子以及小泉首相本人也都先后前往俄罗斯，要求俄先修“安－纳”线。此外，日本还组成精干的专家队伍，对两条石油管线方案以及俄罗斯的有关法律进行深入研究，极力渲染“安－大”线的缺点。日本还积极拉拢有关的俄罗斯地方高级官员。俄滨海边疆区的官员，正是在日本的“授意”下，提出了“安－大”线破坏生态平衡，应优先铺设“安－纳”线的建议。

　　同时，日本充分施展了“金元外交”，向俄罗斯提出了大规模的经济技术合作计划。在日本企业家已经对远东“萨哈林－1”和“萨哈林－2”石油天然气项目投资80亿美元的情况下，日本提出进一步向俄罗斯提供75亿美元协助俄罗斯开发东西伯利亚新油田等十分优惠的条件，迫使俄罗斯政府和有关方面改变已经基本确定的、优先建设“安－大”线的计划。

　　与日本相比，中国方面对中俄能源合作态度较为被动，对俄法律的变动不够适应等，这在很大程度上制约两国能源合作项目的进程。