2002年监测水库17座, 其中10座水库水质达标,达标库容占实测总库容的66.9%,其中主要地表饮用水源密云水库、怀柔水库水质符合二类水体水质标准,官厅水库水质有一定程度改善,但现状水质仍为四类。监测湖泊19个,水质达标的4个,达标湖泊容量占实测总容量的49.3%。与2001年相比,水库、湖泊水质相对稳定。
水库、湖泊的污染类型主要是有机污染。超标的指标是生化需氧量、高锰酸盐指数,其次是氨氮。