日前，《国际癌症杂志》（International Journal of Cancer）刊登了由四川大学华西医院团队发表的基于表观基因组学新方法的脑胶质瘤检测评估新成果，泰莱生物（全称“深圳泰莱生物科技有限公司”，下文简称“泰莱生物”）为重要技术支持单位，泰莱生物表观基因组学研究员张俊博士、顾问科学家谢丹教授为重要作者及通讯作者。
脑胶质瘤是常见的原发性脑肿瘤，占颅脑肿瘤 40-50%，与遗传和致癌环境关联度极高，根据病理和发病部位有不同分型和分类。良性脑胶质瘤一般生长缓慢，细胞分化良好，根治率高；恶性脑胶质瘤患者如原发部位适当，在早期肿瘤体积较小时有机会全部切除，但多数恶性胶质瘤细胞分化不良、生长迅速，且症状随原发部位不同而千变万化，尤其对表达不清、颅内压增高症状不明显、有动脉硬化或退行性神经功能改变等因素的人群，极易出现漏诊和误诊。
临床上对脑胶质瘤的诊断主要依赖 CT 与 MRI，不过其它肿瘤、炎症、缺血等病变亦会出现与胶质瘤难以区分的影像学表达；而基于 ctDNA 的脑胶质瘤鉴定方案，需要借由腰椎穿刺等手段获取患者脑脊液，这一过程需经麻醉、静卧及护理，会给患者带来较大的身心压力和额外的潜在风险。因此长期以来，领域专家致力于寻找出更有效鉴别预测疑似脑胶质瘤，同时具备更安全采样的特色方案。
上周，世界知名肿瘤研究期刊《国际癌症杂志》（International Journal of Cancer）在 2022 年 12 月刊中，刊载了成果论文《基于游离 DNA 中 5 羟甲基胞嘧啶测序的脑胶质瘤无创液体活检鉴别预测》（英文全称：Non-invasive Detection of Brain Gliomas Using Plasma Cell-free DNA 5-Hydroxymethylcytosine Sequencing），该研究由四川大学华西医院主导，泰莱生物为研究技术支持单位，验证了静脉血浆中 cfDNA 5hmC（游离DNA 5 羟甲基胞嘧啶）的测序信号可有效检测到胶质瘤特异表观修饰异常信号，且该方法还可以用于评估胶质瘤 IDH（异柠檬酸脱氢酶）的突变状态，从而实现对脑胶质瘤患者的鉴别和分型预测。四川大学华西医院疾病分子网络前沿科学中心博士后、泰莱生物表观基因组学研究院张俊博士为该项成果的重要作者；四川大学华西医院疾病分子网络前沿科学中心研究员、泰莱生物顾问科学家谢丹教授，四川大学华西医院神经外科主任刘艳辉教授，为本项成果的通讯作者。
研究团队通过采集检测者静脉血浆，构建了包括 180 名胶质瘤患者和 229 名非胶质瘤人群对照组的数据集，发现 cfDNA 羟甲基组和潜在胶质瘤的异常转录之间存在显著一致性。功能分析揭示，致癌和神经通路中差异羟甲基化基因（DhmGs）存在过度表达。在将数据集区分为训练队列和测试队列后发现，测试集（AUC=0.962）以及由 111 名胶质瘤患者和 111 名非胶质瘤人群对照组组成的独立数据集（AUC=0.930）中，用训练集 DhmGs 构建的逻辑模型可将胶质瘤患者区分开来。
上图：利用血浆 cfDNA 5hmC 信号检测有效鉴别胶质瘤
此外，具有突变型和野生型异柠檬酸脱氢酶（IDH）的胶质瘤之间的 DhmGs 可用于训练基础肿瘤 IDH 突变状态的 cfDNA 预测因子（AUC＝0.816），从研究结果来看，预测 IDH 突变型胶质瘤患者的预后明显更好（p＝0.01）。
上图：利用血浆 cfDNA 5hmC 信号预测胶质瘤 IDH 突变状态
“我们基于血浆中 cfDNA 5hmC 测序方法所建立的预测评估模型，可有效获取胶质瘤特异性信号，建立胶质瘤液体活检预测及 IDH 分型模型，得以对脑胶质瘤患者进行鉴别和分型，这样的结果是振奋人心的，因为临床上脑胶质瘤的及时发现对患者的诊疗预后有很大影响。我们期待随着研究的继续深入，这项技术能在胶质瘤的辅助筛查和诊断方面展现出更大的潜力和更多的可能性。”
四川大学华西医院疾病分子网络前沿科学中心博士后、泰莱生物表观基因组学研究员张俊博士介绍，“另一方面，静脉采血的方式具备更强的安全性和依从性，这对于减轻检测者心理压力，维护检测者的诊疗健康有重要意义。”
事实上，该项基于表观基因组学 cfDNA 5hmC 测序的评估方法不仅在上述脑胶质瘤的诊断预测方面有突出表现，四川大学华西医院、泰莱生物等多单位，早先就针对胰腺癌、肝癌、肺癌等进行了单癌种预测评估的联合研究，在多个癌种的辅助筛查与诊断方面积累了高质量的验证经验，相关技术成果均已被 Clinical Epigenetics、ESMO Open 等国际重要期刊收录和刊载。返回搜狐，查看更多
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