《拳皇99·千年之战》（The King of Fighters '99: Millennium Battle）是拳皇系列的第六作，每队的成员由三人改为四人，并将第四名队员在战斗中以援助角色参赛。除了战斗系统作了调整外，本作的主角从草薙京更换成丧失记忆的K'。本作是继《拳皇94》后，关底的BOSS必须连战两场。
从《拳皇99》开始，拳皇的故事进入“音巢篇”，新主角K'被音巢组织改造并植入草薙之火，从而得到操纵火焰的能力。除此之外，该组织还进行生化克隆人实验，企图打造一支拥有草薙京能力的克隆人军团。
三神器家族在合力封印大蛇后，草薙京便离奇失踪，二阶堂红丸、矢吹真吾以及其宿敌八神庵都在寻找他的下落。从音巢组织脱离的K'和马克西姆主动联系红丸和真吾，希望通过参赛来寻找真相。
原本是女性格斗家铁杆队员的不知火舞因赛制改变而加入饿狼队，终于完了与心上人安迪组队的梦想，之后更上演逼婚的戏码……
由于赛制的改变极限流终于可以全家齐上阵，但和以往一样充当搞笑的气氛组。
按理说第四人的空缺应该由小薰担任，无奈她并非习武之人，只好由镇元斋的另一个徒弟小包填补。
哈迪伦自从在《拳皇96》退居幕后就一直没有参加比赛，这次也不例外，第四位队员由新人薇普填补。
这支由《饿狼传说》和《龙虎之拳》的女性角色组成的队伍，最大的问题正好出在饿狼和龙虎二队身上，每当他们缺人时就必然从中挖人，导致最后只剩琼自己一人，这次拉来的三位队友同样来自《饿狼传说》和《龙虎之拳》，也是第一次加入女性格斗家队。
陈国汉和蔡宝健原本就是凑数的角色，第四位队员自然也是新面孔，一位同样修习跆拳道的全勋，与金家藩是竞争对手，赛后一起商量用哪种方法才能更好改造陈蔡二人……
前主角草薙京及其宿敌八神庵成为隐藏角色，必须输入密码才能使用，而两位复制人草薙京则属可选人物，此两人分别继承本尊部分招式，战斗力无法达到本尊的巅峰状态。
和《拳皇94》的卢卡尔一样，脱去外衣后战斗力大增，连招式都改变了。该角色属不可选人物，只能通过hack手段调出，使用时会产生图像错乱等BUG现象。
在单机模式下选用草薙京或组队战中草薙京挑选任意三人（八神庵除外），通关后能看到专属的通关动画。
在单机模式下选用八神庵或组队战中八神庵挑选任意三人（草薙京除外），通关后能看到专属的通关动画。
在NeoGeo CD和PS版中，游戏增加十二个特殊通关画面，比起《拳皇97》和《拳皇98》的特殊组队，本作的组合更加奇葩。
大蛇篇和音巢篇新旧主角共聚一堂，但把真吾弄进来是为什么？让他专职援护？
实在想不出把他们凑一起的理由是什么，另外三位男士喜欢被抽吗？
按字面上的理解，能入队的应该不止这四人，但光挑他们是为什么呢？够奇葩吗？
前面三位就算了，陈国汉哪一点跟“好看”沾边？
总算有一支稍微靠谱的特殊队了，相当于把《拳皇98》少年队的克里斯去掉，然后加入小包和香绯。
全勋的加入貌似勉强，毕竟在《拳皇99》结束后，他才开始参与对陈蔡二人的训练。
原《拳皇98》帽子队的洛奇去掉，加入蔡宝健和小包两个戴帽子的选手。
麻宫从本作才开始理短发，难道就是为了加入这支奇葩的队伍？
四位穿露脐装的选手，赫然发现麻宫是从本作开始才穿露脐装……
真吾和一位真师傅、两位克隆师傅组队，压力山大……
在《饿狼传说》的参赛角色中随意挑四人组队，能看到专属结局……
在《龙虎之拳》的参赛角色中随意挑四人组队，能看到专属结局……返回搜狐，查看更多