Illumina850K/935K甲基化芯片是DNA甲基化研究的利器。然而近期的政策可能会影响这一优秀的工具在国内的使用。在此，我们推荐一款同样优秀的DNA甲基化检测产品：DNA甲基化捕获测序。

甲基化捕获测序相对芯片的优势

🔷 无论基因组背景如何，DNA甲基化捕获测序覆盖400万CpG位点，比Infinium芯片可以检测出更多的位点，同时检测到的位点可包含大部分芯片可检测的位点。

🔷 解决了芯片技术的靶向限制，没有批次效应，提供了更广泛的基因组覆盖。

🔷 性价比高：在成本效益方面，甲基化捕获测序与甲基化芯片的费用处于同一水平，具有相当的性价比。

🔷 准确性：可以准确分析每一个胞嘧啶的甲基化，且没有批次效应。

🔷 创新性：无偏向的位点检测，能够发现新的与疾病关联的甲基化位点。

🔷 捕获测序能得到更多位点与SNP关联的甲基化位点。

🔷 可检测到更精细的甲基化模式，可以从多维度分析甲基化数据，得到了更全面和深入的分析结果。

🔷 可根据研究需求定制捕获区域，适用于不同物种，无需物种特异性芯片。

🔷 可同时检测SNP等遗传变异并进一步分析等位特异性甲基化（Allele-specific DNA methylation，ASM）。

我们构建了全面的甲基化捕获测序数据分析流程，可以从多个维度进行分析甲基化测序数据：

发表于《Epigenetics》期刊的研究论文《Comparison of Methyl-capture Sequencing vs. Infinium 450K methylation array for methylome analysis in clinical samples》从多个角度比较了DNA甲基化测序与芯片技术的优劣。尽管Infinium 450K甲基化芯片曾广泛应用于表观遗传学研究，但其在临床应用中的表现仍存在诸多局限。为此，研究者们系统评估了DNA甲基化捕获测序技术（Methyl-Capture Sequencing，MC Seq）作为替代方案的可行性，为临床甲基化研究提供了新的技术选择。

研究结果表明，DNA甲基化捕获测序（MC Seq）在多个关键技术指标上均表现出卓越性能：

🔷 技术重复性优异：样本内重复实验显示出高度一致性（相关系数r > 0.98），表明该方法具有出色的实验稳定性和可靠性。

🔷 数据可比性强：与主流Infinium 450K甲基化芯片的检测结果呈现高度一致性，在CpG位点覆盖度和甲基化水平定量方面均显示出良好的等效性。

在甲基化技术里面，whole-genome bisulfite conversion (WGBS) 是金标准，但是价格昂贵，数据处理消耗计算资源，结果同时测的深度偏低，不适合做EWAS研究，而Reduced- representation bisulfite sequencing (RRBS) 和Methylated DNA Immunoprecipitation Sequencing (MeDIP-Seq) 都倾向于富含CpG的重复序列而带来偏差，只有甲基化捕获测序克服了这些技术的缺点。

DNA甲基化捕获测序（如Methyl-Capture-Seq）和甲基化芯片（如Illumina的450K、850K、935K芯片）是两种常用的DNA甲基化检测技术，DNA甲基化捕获测序完全可以替代甲基化芯片。以下是两者的比较：

我们为您提供的甲基化捕获测序服务内容，具体包括根据您的课题需求设计实验方案和样本准备方案。

🔷 实验检测服务:甲基化捕获测序文库构建以及测序:

🔷 数据结果报告: 包含数据质控，差异分析，富集分析以及需要可增加高级分析或者定制化分析

如您需要DNA甲基化捕获测序（MC Seq）技术相关应用介绍资料或希望我们的技术支持向您介绍（MC Seq）技术和应用(可在线会议或课题组讲座模式) ，欢迎您随时联系我们!

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