·50年前，铁道部几乎并入大交通部：其实，早在上世纪60年代末和80年代末，决策层就曾两度试图组建大交通部。当时的铁道部、交通部甚至已经奉令搬到一栋楼内。
·2008年，各界争议铁道部改革：对于铁道部目前的体制，厉以宁曾多次调研，印象深刻。厉以宁说，“这是一个半‘计划’的部门，受计划经济影响太深了。”
·整合难题：交通部、民航总局、铁道部三大系统的市场化进展不一，管理体制差异很大，这种不统一制造了整合难题。[详细]

·特殊待遇：铁路公安变成“中直”：此次改制，铁路公检法的“待遇”不一样，其中铁路检察院、铁路法院划归当地管辖，而铁路公安则变成中央直属机构(中直)，铁路民警是国家公务员编制，而非地方公务员编制。
·民航林业农垦都该做大“手术”：国家要以铁路司法转制为突破口，对民航、林业、农垦等系统司法机制，进行一次大的“手术”，让这些部门摒弃部门利益，实现司法“去企业化”，使司法领域内的“独立王国”。