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“人体肠道菌群元基因组研究”登上《自然》封面

来源:新华网
2010年03月04日12:58
  新华网北京3月4日电 我国科学家又一项基因组研究工作受到国际权威杂志的肯定。北京时间3月4日出版的科学期刊《自然》以封面故事的形式,介绍了由深圳华大基因研究院科研人员主要承担的“人体肠道菌群元基因组参考基因集的构建工作”。

  该研究属于欧盟第七框架资助项目——人体肠道元基因组研究计划(MetaHIT)的一部分,得到了科技部和深圳市的支持。深圳华大基因研究院作为唯一的非欧盟研究团体参与到MetaHIT计划中,采用高通量的测序技术和高效能的信息分析平台,取得了一系列突破性研究成果。

  人体除受自身基因的调控外,还受到大量的共生细菌的影响。这些细菌大部分寄生在人的肠道中,通称为肠道菌群,在学术界常被称作“人体肠道元基因组”。该项研究成果收集了124个来自于欧洲人肠道菌群的样本,采用了新一代大规模高通量的测序技术进行深度测序,产出近6千亿的碱基序列。经过序列组装和基因注释分析,从中获得330万个非冗余的人体肠道元基因组的参考基因,约是人自身基因的150倍。这个基因集中包含了绝大部分目前已知的人体肠道微生物基因,但更多的是目前未知微生物的基因。科学家介绍,从这个基因集中可以估计人肠道中存在1000到1150种细菌,平均每个人体内约含有160种优势菌种,并且这些细菌是绝大部分个体所共有的。

  随着社会经济的发展和物质生活水平的提高,一些慢性代谢性疾病如肥胖和糖尿病的发病率日益增加。近十年来,通过在肠道元基因组领域的研究证实,不当的饮食会导致肠道菌群的结构失衡,进而引发慢性炎症,这是造成代谢性疾病的主要因素。但具体是哪些菌群的结构失衡,以及它们如何引发慢性炎症,对这些问题的回答现在仍处于猜测阶段。人体肠道元基因组参考基因集的构建,加深了人们对肠道微生物与人体自身健康关系的理解。

  据了解,在此项研究成果的基础上,深圳华大基因研究院与MetaHIT计划的众多合作单位一起正在开展更深入的研究,以揭示肠道菌群的基因组成与肥胖、肠炎病的关系。此外,深圳华大基因研究院还与北京大学深圳医院展开合作,携手进行人体肠道菌群与糖尿病的关联分析。
责任编辑:赵婷
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