9月9日，台湾《中国时报》报道称，台军沿袭了近80年的军种编制将发生重大变化，台军将陆军导弹指挥部改编为导弹司令部，由原隶属于陆军变为直属国防部，从而使台湾导弹部队一跃升级为独立的第四军种，地位将类似于解放军的“二炮部队”。

　　该报称，根据台“国防部”的计划，新成立的导弹司令部将总管台军的弹道导弹、巡航导弹和防空导弹部队的指挥、作战以及训练事务，将是“精进案”中台军组织改革计划里惟一扩编而且达到司令位阶的部队，导弹司令一职也将从少将提升为中将。其中包括“爱国者—2”型、“天弓”以及“鹰”式导弹等20多个陆军防空导弹连，另外，未来台军将成军的“爱国者—3”型和远程预警雷达部队也将由该司令部管辖指挥。此次台军导弹司令部成立之后，导弹部队将由目前的不足2万人扩编到2.5万人左右。