1942年5月20日，投入中途岛战役的日本联合舰队，在濑户内海中的柱岛锚地集结待命。

　　这支舰队拥有11艘战列舰，23艘巡洋舰，8艘航空母舰，2艘水上飞机母舰，65艘驱逐舰和21艘潜艇，连同后勤船只在内，总计200多艘。

　　而美国太平洋舰队所能集结的，仅有3艘航空母舰（上载233架飞机）7艘重巡洋舰和1艘轻巡洋舰，17艘驱逐舰和19艘潜艇。如果日本人集中使用兵力，中途岛的胜利将唾手可得。

　　但是山本犯了一个大错误。为了迷惑并包围美国舰队，山本将他的庞大舰队分成了五个部分：

　　一、潜艇先遣队，16艘潜艇分成4个支队，被派往珍珠港西南潜伏攻击

　　二、阿留申群岛牵制舰队，拥有2艘航空母舰（上载101架飞机）和4艘战列舰，向东部的阿图岛和基斯卡岛担负佯攻任务，并在岛上登陆；该舰队的一部分将沿着群岛北上，攻击荷兰港。

　　三、中途岛攻击编队，拥有1艘航空母舰（上载24架飞机），两架水上飞机母舰（上载32架飞机），2艘战列舰，以及12艘运兵船，运载共5000名士兵。该编队任务为功占中途岛。

　　四、南云突击舰队，拥有4艘航空母舰（上载261架飞机），2艘战列舰，为轰炸中途岛并寻歼美国太平洋舰队的主力。

　　五、山本主力舰队，由山本大将亲自率领，拥有3艘战列舰，1艘轻航空母舰（上载8架飞机），2艘水上飞机母舰，它将跟在南云舰队的后面，最终消灭美国舰队。

　　5月25日晚，山本五十六大将在他的64000吨超级战列舰“大和”号上举行宴会，把包括南云中一海军中将和草鹿龙之介海军少将在内的几百名将领请到这艘旗舰上赴宴，共祝出征胜利。

　　5月27日是日本的海军节，清晨6时，南云的航空母舰突击舰队，徐徐开出了濑户内海，向丰后水道驶去。其它舰只上的水兵向他们欢呼打气。

　　次日，阿留申群岛牵制舰队从九州北端的港口出发。在南边，满载着5000名士兵的运输舰也从马里亚纳群岛中的塞班岛出发了。

　　5月29日晨，联合舰队的其它舰只也从濑户内海出发－－打头阵的是由近藤信竹海军中将率领的中途岛攻击编队，其后是山本的旗舰“大和”号为首的主力舰队，由34艘舰只组成。这是日本海军在二次大战中规模最大的一次海战，仅这次行动要消耗的油量，就相当于和平时期日本海军一年消耗的油量。