第三一四轰炸机联队的指挥官鲍尔将军及其副参谋长约翰.Ｂ.蒙哥马利上校和其他人都赞同李梅的计划, 但是, 正如同一位中队历史学家后来所写, 不出所料, 该计划“使战斗机组人员疑虑重重。”空勤人员已经习惯了安全的高空投弹方式, 他们担心自己会成为日军高射炮的必然炮灰。但是, 李梅已经分析过敌军高射炮在中低高度并没有什么威力, 并不像欧陆德军的高射炮弹幕令人胆战心惊, 得到的损失统计数字, 并不是很显着。加上李梅分析日军战机的夜战装备不足, 夜间作战能力也就不强 (当然李梅只是凭过去实战轰炸中所的到的数据报告为基础而已, 虽然真实的状况李梅也并不是相当清楚, 但李梅的分析仍是正确的) 李梅意识到他正在冒险, 因此, 他决定延后将计划呈送华盛顿的时间, 由自己承担这次作战任务的全部责任。就算这次任务失败的话, 阿诺德也不用被拖下水一起背黑锅, 他可以置身事外, 顶多丢了饭碗罢了。

　　李梅将轰炸东京的行动定再三月九日的傍晚----几乎是 B-29 堪萨斯之战过去整整一年之后 , (堪萨斯“战役”是为了使 B-29 在最短的期限之内投入战斗并布署海外) 。发动攻击的前一天, 诺斯塔德将军到达第二十一轰炸司令部, 讨论未来的作战行动。听了新计划的汇报之后, 他给华盛顿发了一份电报, 让他们等着看“出色的表演”。李梅在马里亚纳群岛共拥有三百八十五架 B-29 
执行这次任务。领队机----包含鲍尔将军驾驶的那架----装载着 M-47 燃烧弹于下午暮色苍茫时分起飞, 随后起飞的飞机总共携带了两千吨 M-69 集束燃烧弹。

　　在二百七十九架超级空中堡垒中的第一架飞临目标上空前几个小时, 夜幕已经降临在马里亚纳群岛和日本。在关岛, 李梅和几名参谋人员彻夜未眠, 等待着千哩之外的轰炸报告。午夜刚过, 领导轰炸机飞抵首都上空, 随行的其余轰炸机, 按计划作低空飞行, 在与东京最重要的工业区比邻的一个约十平方哩的长方形密集区投下了燃烧弹。熊熊大火倏然而起, 形成了一个完整的 X 型。通常对 B-29 不利的天气这回也帮了大忙, 就在炸弹爆炸前的瞬间, 一阵大风突起, 吹散火焰, 火势迅速蔓延开来。其他的B-29 也跟着陆续投弹, 在各处也燃起了熊熊火势。风速增大到每小时二十八哩, 将燃烧的碎片吹过防火线和沟渠。零散的火焰迅速汇聚成一片汹涌的火海, 后续飞向目标的轰炸机在四十哩外就能看见火光。这些后到的轰炸机穿过滚滚浓烟, 机身和玻璃舱部份都被燻黑了, 炸弹舱门打开后, 建筑物燃烧的的薰味侵入机舱。肆虐的大火还冲起数股强大的气流, 将几架 B-29 转眼冲高了几千尺, 机组人员从座椅上弹了起来, 有些人还重重地摔下座椅, 要不是飞行原有保护头盔的话, 后果真是不堪设想。

　　此次的空袭前后持续了进两个半小时。鲍尔将军投完弹以后, 爬升到正在发动攻击的超级堡垒的正上方, 驾驶着飞机在东京市上空盘旋, 与机组人员一道仔细观察, 收集供日后分析评估的数据资料。鲍尔透过无线电密码将大火焚烧的状况报告给李梅知道, 李梅对此留下的印象极为深刻, 难以忘怀。但是, 东京地面的情况真的是遭透了, 简直是但丁《神曲》中所描写的炼狱。几个小时之后, 东京电台玻放了一则报导, 播音员首先谴责了美国人对人民的“大屠杀”, 接着描述了这场大灾难：“那个火光灿烂的夜晚将远远留在那些目击者的记忆中。当第一批燃烧弹落地之后, 烟雾突起, 并被下面的火光映成一片粉红。超级堡垒穿过浓烟, 超低空飞行在逐渐蔓延的火场中心上空逐一通过。几乎是在市中心的正上方, 一架 B-29 轰炸机轰然爆炸, 犹如一道曳光弹划过在我们的眼前。大火夹着烟雾冲天而起, 火红的天空映衬着黑暗中的议会大厦的塔楼。整个城市亮如旭日, 上空弥漫着浓烟、黑色灰烬和大风吹起的火焰。那天晚上, 我们感到整个东京都将化为灰烬。”