李金华说，开发区面临一些需要研究和解决的问题：

　　国家关于开发区的税收政策面临的问题。审计调查的6个省（市）开发区，2003年以来共减免税款183.56亿元。此外，各地还普遍存在扩大优惠政策范围的问题，如擅自扩大开发区面积、违规认定高新技术企业、批准区内注册区外经营企业享受税收优惠等，由此导致国家税款流失66.47亿元。

　　地方政府关于开发区的财政政策中存在的问题。审计调查的87个开发区中，65个制定了明确的财政返还政策；79个开发区向企业返还120.15亿元。这一做法加剧形成的虚收虚支严重影响了开发区的财政质量。

　　地方政府关于开发区的土地出让政策中存在的问题。调查发现，为“招商引资”，2003年至2005年6月，87个开发区中有60个违规低价出让土地7873万平方米，少收土地出让金55.65亿元。