2006年7月15日，联合国安理会以15个成员国一致赞成的方式通过了关于朝鲜试射导弹问题的第1695号决议，谴责朝鲜7月5日试射导弹。但决议中删除了日本等国提出的有关制裁内容。

　　2006年6月16日，日警告朝鲜说，如果朝鲜再次试射弹道导弹，日朝关系的正常化必将倒退。

　　2005年11月21日，韩国外交通商部长官潘基文为回应19日日本外相麻生太郎关于“小泉首相不会为促成卢武铉总统访日而停止参拜靖国神社”的言论，表示目前韩日关系十分紧张，无法讨论卢武铉总统访日问题。

　　2005年11月20日，小泉与到访的俄罗斯总统普京在东京会晤，就领土争端、地区安全以及经贸合作等问题磋商。21日，俄日签署协定，日本支持俄罗斯加入世界贸易组织，以及在反恐和防止核扩散问题上合作。

　　2005年6月20日，韩国示威民众焚烧日本国旗抗议小泉访问韩国。

　　2005年5月16日，小泉与印度、巴西、德国组成“四国集团”，向联合国其他成员国散发了一项框架决议草案，要求增加6个联合国安理会常任理事国席位。

　　2005年3月17日，韩日独岛（竹岛）问题争端爆发。日本岛根县议会16日通过将2月22日作为“竹岛日”条例，引起坚称对该岛拥有主权的韩国方面强烈抗议。

　　2005年3月，日本增补为联合国常任理事国的呼声日高，新编历史教科书“歪曲侵略历史，声称责任都在中国”，引发中国民间激烈反日情绪。

　　2005年2月10日，日本宣布将钓鱼岛上的灯塔收归国有。

　　2004年3月24日，日方扣押中国民间保钓（钓鱼岛）人士。此举严重违反国际法，而且是对中国的领土权和公民权的严重挑衅。

　　2003年12月16日俄、日签署《共同声明》，原定输往中国大庆的俄罗斯远东小西伯利亚石油被日本提出的“安纳线”取代。

　　2003年1月，日本政府从所谓“民间所有者”手中租借钓鱼岛，中方向日本政府提出严正交涉。同年6月中国大陆保钓人士保钓登岛受日本军舰阻拦。