当前民营企业自主创新存在如下问题：动力不足，不想创新；风险太大，不敢创新；能力有限，不会创新；融资太难，不能创新。

　　对症下药应通过一系列的财政税收政策，建立利益补偿机制，使企业创新有利可图，解决企业不想创新的问题。完善风险分担机制，加大对自主知识产权的保护与激励，营造良好的市场环境和创新氛围，让企业敢于创新。完善创新合作机制，鼓励中小企业与大企业的技术战略联盟，实施有效的产学研合作，推进开放创新，让不同类型和不同规模的企业在互惠共生的环境中提高创新能力。

　　重构为创新服务的金融体制，推进中小企业向创新市场发展，从根本上改变高技术企业融资难问题。

　　实施国家区域创新战略，选择几个产业集群基础好的国家高新技术开发区，建设一批具有国际竞争力的创新集群，优化民营科技企业创新的“小环境”。我国的民营企业是“草根经济”，更多植根于区域创新体系，但民企创新环境需要国家创新体系与区域创新体系的互动。

　　建设创新型国家和推进自主创新，需要坚持分类指导和分步实施的方针，防止各种误区和“一哄而起”的刮风倾向，一步一个脚印地把自主创新的“国家意志”变为“企业行为”。