9月25日，奉节“刘备墓遗址”淹入江中。

　　10月10日，江水漫过云阳张飞庙原址岩壁上的长江最大洪水题刻。

　　10月11日，忠县境内被誉为三峡库区最具价值的古文化遗址“中坝遗址”没入江底。

　　10月15日，三峡地区惟一保存完整的古城、有着1700多年历史的大昌古镇消失在茫茫江水中。

　　10月25日，巫山汉代窑群遗址成水上孤岛。

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　　因为蓄水，三峡库区里众多文物古迹、文化遗存或被江水淹没，或搬迁复原重建，或原地保护。

　　兴建三峡工程前夕，一场大规模的库区文物抢救性发掘和保护工作就提前开始。国家权威部门最后确定，三峡库区文物点为1087处，其中地下文物723处，地面文物364处。

　　一线蓄水前，考古精英聚集三峡，对121个考古项目同期进行勘探和发掘。

　　有“世界第一古代水文站”之称的白鹤梁水文石刻，记录了1200多年来72个枯水年份的长江水位资料，并因历代文人留下的3万多字美妙诗文真迹题刻被誉为“水下碑林”。据了解，这项耗资1.4亿，包括地面陈列馆、交通及参观廊道、水下保护体的白鹤梁水下保护工程将在明年5月竣工。

　　距此近千里的长江下游，秭归屈原祠复建工程也已开工，目前进展顺利。而早在2003年7月，张飞庙搬迁工程就如期完成，一砖一瓦一树均来自旧址。大昌古镇的搬迁工作也相当细致，所有木梁、石墩、瓦片全部编号登记，搬迁到5公里外的新城复原修建。到10月22日，地主宫、关帝庙已近完工。

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　　截至2005年底，地下考古发掘面积达110.7万平方米，已出土珍贵文物9000余件，一般文物17万余件。诸多考古新发现将三峡历史文化的脉络清晰展现出来。

　　丰都高家镇等旧石器时代遗址的发掘，将重庆旧石器文化前推到距今5万~10万年前；丰都玉溪文化下层，距今7000年左右，是我国西南地区目前发现的最早的新石器时代文化遗存。

　　重庆中国三峡博物馆馆长王川平认为，三峡库区文物古迹跨越了旧石器时代、新石器时代、夏商时期、春秋战国时期、两汉和唐、宋、元、明、清朝，堪称一部“中国实物通史”。

　　“过去考古界坚持的是黄河流域中心论，而三峡的田野考古工作将用历史文化遗存证明中华民族的多源一体。从这个意义讲，三峡地区的考古调查和文物保护工作在民族文化中占据重要地位。”中国社科院考古研究所研究员、三峡文物保护规划领导小组成员徐光冀曾公开这样说。