据新华社电11月3日下午，台湾检方宣布结束对“机要费”贪腐案的侦查，认定陈水扁涉嫌贪污和伪造文书，但因其身为台湾当局领导人、享有“刑事豁免权”而暂不予起诉，检方将在其卸任后追诉；认定吴淑珍在案件中诈领1480多万元，涉嫌贪污和伪造文书，对她提出起诉。原陈水扁办公室主任马永成等其他5名被告，分别依照贪污、伪造文书、伪证等罪嫌提出起诉、缓起诉。

　　民进党中央3日晚召开临时扩大中执会，经过长达4小时的讨论，决定对在“机要费”贪腐案中被起诉的陈水扁妻子吴淑珍等4名党员给予“停止党权（行使党员权利）”的处分，并将他们移送民进党中央评议委员会尽速处理。

　　在会议达成的“四点共识”中，民进党中央还要求陈水扁立即对检方起诉书中列举的疑点，作出公开说明。民进党并就“机要费”贪腐案，向台湾社会公开道歉。

　　民进党主席游锡堃称，民进党将在陈水扁作出说明后，于下周继续召开中常会、中执会，讨论该党下一步的行动。

　　在获悉陈水扁涉嫌贪污和伪造文书，其妻吴淑珍被台湾检方依照伪造文书、贪污罪嫌提出起诉后，中国国民党、亲民党、“台湾团结联盟”方面，以及民进党内年轻一代党员纷纷要求陈水扁立即辞职下台。

　　中国国民党主席马英九3日下午举行记者会指出，陈水扁既然被台湾司法机关认定涉嫌贪污和伪造文书，就应以台湾为念、以苍生为念，尽快辞职下台。国民党“立法院”党团表示，陈水扁应主动下台，否则该党团不排除第三次提出罢免陈水扁的提案和弹劾陈水扁的提案。

　　中国国民党3日晚举行临时中常会。会议决定于11月5日下午在台北举行“终结贪腐　人民做主大游行”，号召民众积极参与游行，一起到陈水扁办公场所前要求陈水扁辞职下台。

　　国民党主席马英九介绍说，会议还决定，如果陈水扁不在48小时内下台，国民党将于下周在台湾“立法院”第三次提出罢免陈水扁的提案。

　　在获悉台湾当局领导人陈水扁及其妻子吴淑珍被检方认定涉嫌贪污和伪造文书后，台湾“倒扁总部”3日下午立即号召民众重回凯达格兰大道，进行集会活动，促使陈水扁尽快辞职下台。截至3日18时，已有部分民众聚集在台北火车站前，他们用鸣汽笛、放鞭炮等方式，表达对吴淑珍遭起诉的喜悦心情。一些民众则已自行走向凯达格兰大道。

　　截至记者发稿时，陈水扁夫妇对此未作出任何公开回应。

　　又讯国务院台湾事务办公室新闻发言人3日说，陈水扁鼓吹制定所谓“第二共和宪法”是又一危险举动。我们坚决反对陈水扁通过“宪改”谋求“台湾法理独立”的立场是坚定的、不可动摇的。不管其玩弄什么花招，其“台独制宪”的图谋都必然遭致彻底的失败。

　　陈水扁“机要费”贪腐案的来龙去脉

　　台湾当局领导人陈水扁每年有4800万元（新台币，下同）的“机要费”。2006年7月20日，国民党籍“立委”邱毅向媒体出示总金额逾70万元的8张发票复印件，指称这些发票被陈水扁妻子吴淑珍用来虚报“机要费”，并认为“机要费”的使用隐藏着重大贪腐内幕。陈水扁“机要费”贪腐案由此爆发。

　　在岛内舆论的压力下，台湾审计部门开始对“机要费”进行审计，结果发现陈水扁2005年报销的“机要费”中，约七成七无支出发票或发票不合格，涉及款项超过3600万元。审计部门以“疑似有不法情形”为由将全案移送“台湾高检署”侦办。

　　8月16日，“机要费”贪腐案获重大突破。被指称涉案的李碧君坦承拿过堂妹李慧芬提供的总金额达数百万元的发票，其中的一部分给了吴淑珍。8月23日，邱毅又揭露，陈水扁的“机要专员”陈镇慧每月都会领出200万元“机要费”，分配给陈水扁夫妇及女儿陈幸妤、儿子陈致中等人花费，只要消费之后把发票交给陈镇慧，就可以报销。

　　在“机要费”贪腐案被揭发后，陈水扁及其办公室多次否认报假账，直到9月5日，陈水扁才首次承认曾以他人的单据及发票来报销“机要费”。