尽管清修古墓的主人是不是秦桧尚未确定，但对于清修古墓是“南京有史以来发现的规模最大的宋代古墓”一说，考古总指挥华国荣表示了认可。目前现场的考古人员对于外界的种种说法一概不置可否，对于是否“秦桧墓”问题更是三缄其口，甚至连该墓是否为“秦桧家族墓”也均以“不知道”回答。由于考古工作进展缓慢，而考古人员又总是以“欲知谜底，且看进展”的态度来回答媒体的提问，这座揭不开谜底的宋代古墓神秘感持续增强。

　　谜团一：发现的女性头骨与盆骨究竟属于何人？

　　在M3号墓室内发现的女性头骨和盆骨吸引了大多数媒体注意，甚至有媒体报道称这两块骸骨都属于墓室男主人的“小妾”。然而令笔者感到奇怪的是，既然现场总指挥华国容已经确认墓室内的棺材并未开启且未遭破坏，这两块骨头如何会现身于棺材之外呢？华国荣在笔者追问下说，已发现的两块骨头究竟是何人的尚不能确定，棺材内是否还会有一具骸骨，开棺清理后便会揭晓。

　　谜团二：墓主到底是谁？

　　已发现的墓志是揭开墓主的关键。按照宋朝惯例，在夫人墓室的墓志上，一般包含有“宋故某官某人某某夫人”的字样。目前考古人员仅能看到的“宋故”两字提供不了关于墓主身份的有用信息，被棺材挡住的部分墓志已成为众人翘首以待的内容。据华国荣介绍，墓志必须要等到M3号墓室内棺材清理完毕后才能出土。按照目前的考古进度来看，可能尚需2-3天的时间。

　　谜团之三：墓室内的文物究竟还有多少剩余？

　　此次清修古墓被发现，还源于盗墓者的光顾。华国荣向笔者证实，3座墓室都有不同时期的被盗痕迹，但因此损失了多少文物目前还不能确定。