“十二五”规划编制工作的指导思想是：以邓小平理论和“三个代表”重要思想为指导，全面贯彻落实科学发展观，根据国内外发展环境的新变化，立足首都发展的新阶段、新要求，紧紧围绕建设“人文北京、科技北京、绿色北京”和世界城市的发展战略，采取政府主导、部门牵头、专家咨询、公众参与、综合衔接、分级发布的组织方式，进一步强化规划的战略性、指导性、约束性和可操作性，系统谋划、科学实施，推动首都经济社会全面协调可持续发展。
政府主导。就是在市委、市政府的领导下，充分发挥各区县和各部门在规划编制中的组织协调作用，统一部署，扎实推进。
部门牵头。就是各个政府部门要按照职责和市级规划体系确定的分工方案，组织抓好相关规划编制工作，做到任务明确、责任落实。
专家咨询。就是在规划编制过程中，注重用好外脑，聘请知名专家和研究机构，提供跟踪指导和智力支持。
公众参与。就是坚持开门搞规划，多种渠道、多种形式地广泛听取市民意见，努力把“十二五”规划编制成为凝聚民心、集中民智、体现民意的规划，使规划编制成为科学决策、民主决策、依法决策的过程。
综合衔接。就是在规划的论证和审查阶段，要从内容的科学性、程序的规范性，从市级规划与区级规划、综合规划与专项规划等多方面，进行综合衔接、统筹平衡，使“十二五”规划成为有机整体。
分级发布。具体地讲，市级综合规划由市政府提出，市人民代表大会审议批准；市级重点规划、市级一般规划由市政府审议批准，或由相关委办局审核发布实施。区县综合规划由区县人民代表大会审议批准和发布。
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