万物有灵且美
光是龙猫真实存在这件事，
就可以让小月和小梅获得解救。
只是存在而已……
一生当中只要
遇过一次龙猫就够了。
——1988年6月
宫崎骏重新认识和肯定日本已经是30岁之后。第一次从欧洲回来，他突然感到自己是多么喜欢岛上的草木自然。
“儿童和青少年时期最关心的事情还是女孩子，根本不可能去喜欢植物。30岁之后，看到山毛榉枝头长出的嫩芽，竟忍不住惊叹起它的美丽。从那一刻起我开始对植物产生兴趣。”宫崎骏说。
格林童话里，主角会睡在森林的树洞中。宫崎骏很难想象那个画面。因为，假如是在日本，昆虫肯定会爬满全身，什么种类都有。这一刻，他会想：“啊，我果然是日本人！”
也是在30岁的时候，宫崎骏看到了中尾佐助的“照叶树林文化论”(讲述日本文化源头的文化人类学理论，照叶树林就是常绿阔叶林)。宫崎骏喜爱麻薯和纳豆等黏性食物，年轻时最爱在明治神宫的阔叶林中散步，小时候会听爱说故事的母亲讲述山梨县的山村点滴。这些都因“照林树林文化”交织在一起，让宫崎骏“真正明白了自己的出身”。
“我恢复自信的原因不在于日本制造的车子和家电制品，而在于一本书给了我力量。”“发动战争的愚蠢日本人、攻击朝鲜的丰臣秀吉、最讨厌的《源氏物语》……当我知道自己可以跨越这些禁锢，将心底奔流的思绪与照叶树林相连时，感觉很舒畅，真的是解脱了。”“这本书给了我一个出发点。无论是对于历史、国土或是国家， 我都看得比以前更加清楚。”
绳文时代(日本旧石器时代后期)充满奔放创意的土器让宫崎骏体会到自豪。连青春期曾给宫崎骏带来很大困扰的鼻子形状问题也解决了，因为发现它像绳文时代人的鼻子。宫崎骏甚至称绳文时代为日本人最幸福的时代，——“没有国家和战争，也没有充满巫术的宗教。我想，此时代必定非常祥和，人们的个性必定善良温厚。万物有灵是他们最朴实的信仰。”
万物有灵也成了宫崎骏的信仰。他迷上了树，因为树最能象征这个复杂多样化的世界。“树不只是树，一棵树上有许多寄生或共生的生物。人类的时间、鸟的时间、虫的时间，或者细菌的时间，各有各的时间观，却可以同时存在于一棵树上。”
早上走进工作室，宫崎骏会跟空无一人的屋子说“早上好”。他的解释是：“这里有人的哦，虽然我不知道是谁，不过肯定有的。”这会让人想起《幽灵公主》中，阔叶树林里忽隐忽现的半透明白色小人，转动脑袋一起发出嗒嗒嗒的瘆人声音。
他从不在过年时前往神社参拜，因为他不认为神会存在于那样金碧辉煌的神社里，既然是日本人的神就应该住在深山幽谷里。他曾带着幼年的儿子去冲绳的山中见到最接近原始风貌的神社，拜的神体是石头或树。昏暗寂静的空间里蝴蝶到处飞舞，氛围阴森森的。儿子吓得直叫“好怕，好怕”。感觉好像有什么东西存在着。
宫崎骏解释，对日本人来说，那种“害怕”的心情其实就是对森林的一种尊敬之情——也就是所谓的原始宗教、万物有灵。“欧洲系列的童话思想都认为光明象征正义，黑暗象征邪恶。我不喜欢这样的论调。对日本人来说，神就存在于黑暗中。”“自然是混沌不明的，因为里面一定是暗藏玄机。这个世界的现象不是一句超自然或神秘就可以解释清楚的。这个世界并不是只为了人类才存在，所以有鬼怪之类的存在也是很自然的事。”“那样的感觉会与自己内心深处的幽暗面相联系，而当那样的感觉消失时，自己内心所存在的阴暗面也会消失，这时便能感觉负面的自我意识越来越淡薄。”
“日本人似乎不会希望神明来解救自己的灵魂。”宫崎骏说：“虽然嘴里口口声声说死后要去哪里，但其实心里不会马上想到西方极乐世界或是天国，反而认为在山林间或泥土里立地成佛，才是最好的结局。”
丰饶的自然同时也可能是凶残的自然。平时微笑的神明也可能会变成凶暴的神，“不过，一旦镇压之后，就会变成面带笑容的和蔼神明。我比较喜欢这样。”宫崎骏说。也许正因为这样，除了作为背景、面目模糊的军队和战争，宫崎骏的电影里几乎没有真正的反派，反派的身上总有让人理解的部分，有时是财富或权力带来的贪婪或自我膨胀，有时是神灵对人类破坏自然的抗议……电影的最后，他们往往都和解或改正了。这不是动画片或通俗电影通常的方式，《风之谷》引进到美国时，名字被改成了《风之战士》。
宫崎骏不大喜欢被人说是环保主义者，因为万物有灵不是为了人类着想，只是不想破坏自然。“对人类有害的就是害鸟，对人类有益的就是益鸟，这种说法很奇怪。”他在家里不会开冷气，不用洗衣粉，用天然肥皂丝。院子里枯死的圆木中跑出飞蚁，太太害怕木造地基被啃坏，要烧掉圆木，宫崎骏却说，不要烧，家里就算被啃坏也无所谓。夫妻俩争论的问题常常是：盆栽里有了毛毛虫，把叶子啃得乱七八糟，到底是该保护盆栽，还是应该保护毛毛虫。
不过转头，他又会想得很开。圆木还是被太太烧掉了，那就烧掉吧。“我其实是个纵使明白地球即将毁灭也会活得开朗又快活的人。因为，我心里虽然知道大家都会死，但毕竟现在大家都还活得好好的。”他会笑着说。
这也颇像他对待国家的态度，一边各种忧心忡忡，一边会说：“我是一个认为国家再糟也不会拖累我的人。也就是说，就算国家破产了，大家还是有办法活下去。虽然我们随便就把国家挂在嘴巴上，国家太愚昧而不图振作时也会让国民很难堪，可是所谓的民族也好、人民也罢，都跟国家没有关系。”
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